Проверить, не заражен ли ваш сайт, можно на сервисе Яндекс.Вебмастер. Для этого зайдите в раздел «Безопасность». В данном случае с сайтом все хорошо.

Но обратите внимание, что Яндекс проверяет страницы выборочно.

Поэтому нельзя гарантировать, что где-нибудь не спрятался вирус, о котором Яндекс еще не знает. И если сайт заражен, то в результатах поиска рядом с ним будет показываться предупреждение.

В этом случае надо найти и сразу удалить заражение, а потом отправить сайт на перепроверку.

Важно сделать это как можно быстрее, так как пользователи боятся заходить на зараженный сайт. Кроме того, ранжирование зараженного ресурса обычно ухудшается.
Совет: на сервисе Яндекс.Вебмастер можно получать уведомления о зараженных страницах. Настройте пересылку этих уведомлений на рабочую почту, чтобы сразу узнавать о возникших проблемах.

Источник (видео): Что происходит с зараженным сайтом