- Используем сервис приоритетный переобход страниц (Яндекс.Вебмастер).
- Используем сервис Сообщить о новом сайте https://webmaster.yandex.ru/addurl.xml.
- В рамках структуры сайта, должны быть ссылки на все страницы.
- Внешние ссылки на новые страницы.
- Устраняем технические ошибки (SEO-аудит сайта: дубли, битые ссылки, ошибка 404 и др.).
Необходимо дождаться индексации изменений и обновление поисковой базы (апдейт). За апдейтами можно следить тут — http://tools.promosite.ru/
Если через некоторое время, ситуация не исправляется, можно попробовать написать в тех. поддержку Яндекса о проблемах индексации сайта, выявить причины.
В продолжении темы — как определить количество проиндексированных страниц в Яндексе?